O Programa de Pós-graduação em Geografia Física (PPGF) está vinculado à:

• Comissão Coordenadora do Programa (CCP): instância básica de organização e de decisões de toda a vida acadêmica de cada Programa de Pós-graduação;
• Comissão de Pós-Graduação (CPG) da Faculdade de Filosofia, Letras e Ciências Humanas (CPG-FFLCH);
• Pró-Reitoria de Pós-Graduação (PRPG) da USP.

A CCP reúne-se mensalmente para discutir os direcionamentos e metas do Programa e desempenhar todas as atividades que lhe são atribuídas pela Resolução Nº 6542, de 18 de abril de 2013, no seu Artigo 38, Capítulo V.